Xác định trình tự axit amin là một cách quan trọng để hiểu được tính chất và chức năng của protein. Vùng đầu N là phần cấu trúc và chức năng quan trọng của protein và peptide. Độ đặc hiệu trình tự của nó rất cao. Hầu hết các protein có thể được xác định bằng cách xác định dư lượng đầu N. Các phương pháp giải trình tự đầu cuối protein N chủ yếu được chia thành hai loại, đó là công nghệ quang phổ khối và công nghệ quang phổ không khối lượng. Công nghệ quang phổ không khối lượng chủ yếu là phương pháp phân hủy Edman cổ điển.
Phép đo khối phổ (Giải trình tự dựa trên khối phổ) là một phương pháp phân tích đo tỷ lệ khối lượng trên điện tích của các ion. Trong giải trình tự protein, phép đo phổ khối sơ cấp chủ yếu cho biết trọng lượng phân tử của mục tiêu, phổ sơ cấp GC-MS có thể được phân tích định tính, LC-MS có thể được sử dụng để xác định trọng lượng phân tử đơn giản và phép đo phổ khối song song có thể được sử dụng trực tiếp để xác định amino trình tự axit của peptit. Phương pháp quang phổ khối sử dụng khối lượng peptide đo được để tìm kiếm thư viện protein và kết hợp với các thuật toán máy tính thích hợp, protein có thể được xác định. Công nghệ quang phổ khối sinh học có độ nhạy cao, độ chính xác cao, độ phân giải cao và thông lượng cao mang đến sự lựa chọn quan trọng cho việc giải trình tự đầu N của protein.
Phương pháp phân hủy Edman do P. Edman sáng tạo, đó là phản ứng polypeptide/protein với phenyl isothiocyanate (PITC) trong điều kiện kiềm yếu, sau đó xử lý nó bằng axit để chỉ giải phóng dư lượng đầu amino khỏi chuỗi polypeptide trong dạng dẫn xuất phenylthiohydantoin của axit amin, sau đó phân tích nó. Phương pháp suy thoái Edman có thể được giải trình tự trực tiếp mà không cần dựa vào kết hợp cơ sở dữ liệu. Nó vẫn là một công nghệ nghiên cứu có giá trị để phân tích trình tự đầu N của protein tinh khiết và protein mới được phát triển (không dựa vào cơ sở dữ liệu đối sánh). Tuy nhiên, phương pháp phân hủy Edman phải tuân theo các hạn chế sau, chẳng hạn như protein hoặc polypeptide được sử dụng để phân tích trình tự phải có độ tinh khiết cao, các protein bị chặn ở đầu N khó phản ứng với Edman, không phù hợp để phân tích thông lượng cao và không đủ nhạy cảm.
Tóm lại, với sự phát triển và cải tiến liên tục của công nghệ giải trình tự suy thoái Edman cổ điển và công nghệ giải trình tự dựa trên khối phổ, phân tích trình tự đầu N của protein và peptide đã thu được thông tin trình tự peptide đầu N phong phú, cung cấp cơ sở vững chắc cho kết quả chính xác. xác định protein và đào sâu nghiên cứu của chúng tôi về cấu trúc và chức năng của protein.